第五次党员大会于1962年8月26日至28日召开。在568名党员中，选举产生并经上级党委批准党委委员31人、监委委员7人，在五届一次党委会上，选出杨伯箴、马驰、高秀山、施宗恕、田珮之、于文周、朱学、仓孝和、张毓珣、张天泳、黎超、黄耘、晋劲敏、刘国盈等为党委常委，杨伯箴继任党委书记，马驰任党委副书记，高秀山、施宗恕继任党委副书记。高秀山兼任监委书记，黎超任监委副书记。11月13日，中共北京市委大学科学工作部下达文件，同意杨云芝为党委常委。1963年10月，杨伯箴调离，1965年2月，冯佩之调入，11月23日，中共北京市委组织部下达文件，冯佩之任北京师范学院党委书记兼院长。同年9月，刘寿彭调入任党委副书记、副院长。